RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 H0Y8X5 98 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 DFFAO00273 331 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RAD51BO15315 384 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 DAPK3O43293 454 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 LATO43561 262 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MAFKO60675 156 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MTA2O94776 668 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 LCA5LO95447 670 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GSRP00390 522 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PRKCGP05129 697 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT2B4P06133 528 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TIMP2P16035 220 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 HTR7P34969 479 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXD12P35452 270 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ETFBP38117 255 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CCR5P51681 352 aa7.11□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 SEMG2Q02383 582 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPRRQ15256 657 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF284Q2VY69 593 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PARP15Q460N3 678 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM46CQ5VWP2 391 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RETSATQ6NUM9 610 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PIP4P1Q86T03 277 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS36Q86VN1 386 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CNGA4Q8IV77 575 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PQLC3Q8N755 202 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB124Q8NES8 71 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2AP1Q8NGE2 309 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TEKT4Q8WW24 435 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 BMFQ96LC9 184 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC42Q96M95 316 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MYOCQ99972 504 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 HDAC8Q9BY41 377 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 DEF6Q9H4E7 631 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.11□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0U1RQS6 177 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PQU0 124 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC72A6NJI9 287 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BRJ5 948 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 MFSD11O43934 449 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SH3BP5O60239 455 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNK5O95279 499 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PRNPP04156 253 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ADRB3P13945 408 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GNSP15586 552 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PRLRP16471 622 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 KDELR1P24390 212 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGB7P26010 798 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CTSKP43235 329 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEA1P43355 309 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN2P57739 230 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MAXP61244 160 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 IL9RQ01113 521 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 IL10RBQ08334 325 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ADCY2Q08462 1091 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 BNIP3Q12983 259 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TCEAL1Q15170 157 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 LLGL1Q15334 1064 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-BQ31612 363 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PPM1JQ5JR12 505 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.1□□□□□ -1.27
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