RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRAME-210ENST00000442481 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.515e-58■□□□□ 11.1
PRAME-210ENST00000442481 CNTN5O94779 1100 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SERPING1P05155 500 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 RHOCP08134 193 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 PRLRP16471 622 aa11.87□□□□□ -0.51
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PRAME-210ENST00000442481 GSCP56915 257 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
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