RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 LGALS2P05162 132 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 AKR1D1P51857 326 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SDE2Q6IQ49 451 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 NPAS2Q99743 824 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 OR6B1O95007 311 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CKMP06732 381 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CRATP43155 626 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 LGALS3BPQ08380 585 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 NEPROQ6NW34 567 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 DLK2Q6UY11 383 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SPATA20Q8TB22 786 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC19Q9H756 370 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 RNF19AQ9NV58 838 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 BTBD19C9JJ37 291 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 GSC2O15499 205 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SSNA1O43805 119 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 FGFR1P11362 822 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 OR1E1P30953 314 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 GSTM5P46439 218 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 RENBPP51606 427 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM32Q13049 653 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PROX1Q92786 737 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CERS2Q96G23 380 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TCF12Q99081 682 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SYT15Q9BQS2 421 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CYP1A2P05177 515 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 URODP06132 367 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ABHD2P08910 425 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CYP2A7P20853 494 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 WEE1P30291 646 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PARP6Q2NL67 630 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SLIT2O94813 1529 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SNAP91O60641 907 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CST1P01037 141 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF846Q147U1 533 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 FAR1Q8WVX9 515 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 OPTCQ9UBM4 332 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 DHRS12A0PJE2 317 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 HACD1B0YJ81 288 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TIPRLO75663 272 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ELNP15502 786 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SLC26A3P40879 764 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TRABD2AQ86V40 505 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 IQCKQ8N0W5 287 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CMTM6Q9NX76 183 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 C3orf18Q9UK00 162 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ATRNO75882 1429 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 FFAR3O14843 346 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 GPR42O15529 346 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 EPS8Q12929 822 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 HPS6Q86YV9 775 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 VPS35Q96QK1 796 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CITED4Q96RK1 184 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ABCG8Q9H221 673 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 KLRC4O43908 158 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 WFS1O76024 890 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SEMA3DO95025 777 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 LHX1P48742 406 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CDC42P60953 191 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PLCL1Q15111 1095 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms