RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.94□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa4.94□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa4.94□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.94□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PTPN13Q12923 2485 aa4.94□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 BLACEA4D250 179 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TTC34A8MYJ7 566 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 LINC01387J3KSC0 135 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SHOXO15266 292 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ARHGAP6O43182 974 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 STX6O43752 255 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SLC28A2O43868 658 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PCDHGA12O60330 932 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 MT-CO1P00395 513 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CTSBP07858 339 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 P4HA1P13674 534 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 LCP1P13796 627 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 VAV1P15498 845 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 LPOP22079 712 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CD38P28907 300 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CDC25BP30305 580 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 GCLMP48507 274 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 RGS7P49802 495 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TKTL1P51854 596 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 KIF11P52732 1056 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 COG7P83436 770 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ADIGQ0VDE8 80 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CUL4BQ13620 913 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ENPP2Q13822 863 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SHBQ15464 509 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 USP53Q70EK8 1073 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TADA2BQ86TJ2 420 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ADIPOR2Q86V24 386 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PIGZQ86VD9 579 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TMPRSS12Q86WS5 348 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ERICH1Q86X53 443 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TEX19Q8NA77 164 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM145Q8NBT3 493 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ADCY4Q8NFM4 1077 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 RNF139Q8WU17 664 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 KLK6Q92876 244 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 FGF11Q92914 225 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 EEF2KMTQ96G04 330 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 C1orf159Q96HA4 380 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM176AQ96HP8 235 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SERAC1Q96JX3 654 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NEUROG2Q9H2A3 272 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TNMDQ9H2S6 317 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NLRC4Q9NPP4 1024 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 GDF3Q9NR23 364 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 KLHL11Q9NVR0 708 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 FBXO10Q9UK96 956 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CLCA2Q9UQC9 943 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 MGAQ8IWI9 3026 aa4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 MYLKQ15746 1914 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D3EA0A087X179 549 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 A0A1W2PPC4 97 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 FAM170AA1A519 330 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PMS2P1A4D2B8 440 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 LRRC72A6NJI9 287 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D3LB9A6J9 549 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms