RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SEMA5AQ13591 1074 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PARP6Q2NL67 630 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ALS2CLQ60I27 953 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TTC16Q8NEE8 873 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 VAT1Q99536 393 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 IGFLR1Q9H665 355 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PIDD1Q9HB75 910 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CCL26Q9Y258 94 aa6.15□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 F5H423 210 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TBL1XO60907 577 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CCNB1P14635 433 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TPSB2P20231 275 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PSMB4P28070 264 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 AVPR1AP37288 418 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 POLD2P49005 469 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ARL4CP56559 192 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SERINC3Q13530 473 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TPSAB1Q15661 275 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TEX44Q53QW1 395 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PID1Q7Z2X4 250 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 FATE1Q969F0 183 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 GBA3Q9H227 469 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GVM2 712 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 GFRA2O00451 464 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 JCHAINP01591 159 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 HIF1AQ16665 826 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ANO4Q32M45 955 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CPXM2Q8N436 756 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ING5Q8WYH8 240 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MAML1Q92585 1016 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ZIM3Q96PE6 472 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 IL12RB2Q99665 862 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PLAAQ9Y263 795 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.15□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 NUP205Q92621 2012 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 E2F8A0AVK6 867 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 E7EVH7 732 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 J3KR12 359 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 RIPK2O43353 540 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 AHCYL1O43865 530 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 APRTP07741 180 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ACVRL1P37023 503 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 POLE2P56282 527 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 BPIFB3P59826 476 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 HYAL1Q12794 435 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 EMC10Q5UCC4 262 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 POTEHQ6S545 545 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CENPUQ71F23 418 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ITFG1Q8TB96 612 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TEKT5Q96M29 485 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MAGEH1Q9H213 219 aa6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SP110Q9HB58 689 aa6.14□□□□□ -1.43
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