RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TREML2Q5T2D2 321 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL17Q6TDP4 642 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 UBASH3BQ8TF42 649 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 C9orf16Q9BUW7 83 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 EFCAB10A6NFE3 127 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 TLL1O43897 1013 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ITGAXP20702 1163 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 GRIA4P48058 902 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 MAT2BQ9NZL9 334 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 RPL38P63173 70 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 GCNT7Q6ZNI0 430 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CREG2Q8IUH2 290 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ALLCQ8N6M5 410 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF671Q8TAW3 534 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF232Q9UNY5 417 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ISM1B1AKI9 464 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CSH1P0DML2 217 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CSH2P0DML3 217 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 UQCRBP14927 111 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 DHRSXQ8N5I4 330 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 TOR4AQ9NXH8 423 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 BCL9O00512 1426 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 DGCR6Q14129 220 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 LGMNQ99538 433 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ANAPC2Q9UJX6 822 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 TFEBP19484 476 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 RPL22P35268 128 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFV1P49821 464 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CREMQ03060 361 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 FAM151BQ6UXP7 276 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP52Q8N1V2 620 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJB14Q8TBM8 379 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 BRD9Q9H8M2 597 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CHKAP35790 457 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 MTAPQ13126 283 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 RNF157Q96PX1 679 aa22.56■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 KRT33AO76009 404 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 BRCC3P46736 316 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 NAGLUP54802 743 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 SNAP47Q5SQN1 464 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 TEKT5Q96M29 485 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 MBOAT7Q96N66 472 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC189A1A4V9 331 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 MSCO60682 206 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CXCL14O95715 111 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 TRAF3Q13114 568 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 PTPRNQ16849 979 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 PWWP2AQ96N64 755 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 YDJCA8MPS7 323 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 IDH2P48735 452 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 TTPAP49638 278 aa22.55■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 GRIP2Q9C0E4 1043 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 COPG2Q9UBF2 871 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 LRATO95237 230 aa22.55■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 ADH1AP07327 375 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 CTBP1Q13363 440 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CDYL2Q8N8U2 506 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 DEPDC5O75140 1603 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00032P0C843 101 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF24P17028 368 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 BTN2A1Q7KYR7 527 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CYP2C18P33260 490 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.54■■□□□ 1.2
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