RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317147.9

CNOT1-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT1, Length 8,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1-201ENST00000317147 RABL3Q5HYI8 236 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 SULT1C3Q6IMI6 304 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 CYS1Q717R9 158 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 ANKMY2Q8IV38 441 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 REPS1Q96D71 796 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 CRELD1Q96HD1 420 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 FOPNLQ96NB1 174 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 WRNIP1Q96S55 665 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 ADAMDEC1O15204 470 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 S100A6P06703 90 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 GALK1P51570 392 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 S100A12P80511 92 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 HSF2Q03933 536 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 BST1Q10588 318 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 MTMR1Q13613 665 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 SELPLGQ14242 412 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 GRM2Q14416 872 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 KRT33BQ14525 404 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 SLX4IPQ5VYV7 408 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 LIN54Q6MZP7 749 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 ZNF720Q7Z2F6 126 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 OR8H2Q8N162 312 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 FAM47BQ8NA70 645 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 MCOLN3Q8TDD5 553 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 PCSK1NQ9UHG2 260 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 TBX20Q9UMR3 447 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 E5RI56 91 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 MYL12BO14950 172 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 CYP26A1O43174 497 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 LINGO3P0C6S8 592 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 CES1P23141 567 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 GLRA2P23416 452 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 TRIM23P36406 574 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 COX10Q12887 443 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 ZNF280DQ6N043 979 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 PGAP1Q75T13 922 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 NIM1KQ8IY84 436 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 ATPAF2Q8N5M1 289 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 LRRC20Q8TCA0 184 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 MNTQ99583 582 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 KIFC1Q9BW19 673 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 CLPBQ9H078 707 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 OSGEPQ9NPF4 335 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 USP18Q9UMW8 372 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 RPTORQ8N122 1335 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 RIC1Q4ADV7 1423 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 AIREO43918 545 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 UGT1A9O60656 530 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 SCELO95171 688 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 UGT1A6P19224 532 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 UGT1A1P22309 533 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 UGT1A4P22310 534 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 AMPD1P23109 780 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 UGT1A3P35503 534 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 UGT1A5P35504 534 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 CASP4P49662 377 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 GPSM2P81274 684 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 RBP5P82980 135 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 NCOA4Q13772 614 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 PTPRNQ16849 979 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 CYP51A1Q16850 503 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 XKR3Q5GH77 459 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 GALNT18Q6P9A2 607 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 KCTD1Q719H9 257 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 SPATA19Q7Z5L4 167 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 MPP5Q8N3R9 675 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 POF1BQ8WVV4 589 aa4.55□□□□□ -1.68
CNOT1-201ENST00000317147 SHC3Q92529 594 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms