RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa17.76■□□□□ 0.43
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SCARB2-201ENST00000264896 APOL4Q9BPW4 351 aa17.74■□□□□ 0.43
SCARB2-201ENST00000264896 RTKNQ9BST9 563 aa17.74■□□□□ 0.43
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SCARB2-201ENST00000264896 A8MUI8 341 aa17.74■□□□□ 0.43
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