RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA18Q8TC71 538 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 STK32AQ8WU08 396 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CPT1BQ92523 772 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPH1Q92598 858 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF560Q96MR9 790 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GKN1Q9NS71 199 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SIX4Q9UIU6 781 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 PTPN13Q12923 2485 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 H7C4K7 107 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 FAM163BP0C2L3 166 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ETS1P14921 441 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 GABRR2P28476 465 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINB9P50453 376 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 EPHB3P54753 998 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC13P55735 322 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF280DQ6N043 979 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ARCQ7LC44 396 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF605Q86T29 641 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 CEP120Q8N960 986 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MCUQ8NE86 351 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC16Q8NEE8 873 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 RIN3Q8TB24 985 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 RNF157Q96PX1 679 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF670Q9BS34 389 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 SAR1AQ9NR31 198 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL26Q9Y258 94 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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