RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 GAKO14976 1311 aa16.58■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 SLC6A2P23975 617 aa16.58■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 USP46P62068 366 aa16.58■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.58■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 MRASO14807 208 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 USP12O75317 370 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 CACNA2D1P54289 1103 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 FAM124AQ86V42 546 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 NELL1Q92832 810 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 CKLFQ9UBR5 152 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 HMGCRP04035 888 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 PGM5Q15124 567 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 REPS2Q8NFH8 660 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 RECQL4O94761 1208 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 CEBPGP53567 150 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 RAB25P57735 213 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 GMFBP60983 142 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 OR7A2PQ8NGA2 310 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 TTPAP49638 278 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ACLYP53396 1101 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 PTPN5P54829 565 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 IRF8Q02556 426 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 NAT16Q8N8M0 369 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 OR4A15Q8NGL6 344 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 MYOCQ99972 504 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.58■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ACVR2BQ13705 512 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 MYBPC3Q14896 1274 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF34Q8IZ26 560 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 HDCP19113 662 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 OR2L5Q8NG80 312 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 GIMD1P0DJR0 217 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 21.4
LAMC1-201ENST00000258341 SF1Q15637 639 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF410Q86VK4 478 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ABRAQ8N0Z2 381 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 HAVCR1Q96D42 359 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 APOPT1Q96IL0 206 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 SLC39A8Q9C0K1 460 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 GIT1Q9Y2X7 761 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 TP73O15350 636 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 PROCP04070 461 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ALAS2P22557 587 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 PKNOX1P55347 436 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 CREMQ03060 361 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 NR1D2Q14995 579 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 SV2AQ7L0J3 742 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 TLL1O43897 1013 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 MLYCDO95822 493 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 MANFP55145 182 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 STAG3L4Q8TBR4 150 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ATL1Q8WXF7 558 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 AP3S1Q92572 193 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF607Q96SK3 696 aa16.57■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ARPINQ7Z6K5 226 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 FNDC11Q9BVV2 318 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 BRD9Q9H8M2 597 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 FCHO1O14526 889 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 SPIRE1Q08AE8 756 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 RNF19AQ9NV58 838 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 REREQ9P2R6 1566 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 LRATO95237 230 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 ITGA2P17301 1181 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 PSMB4P28070 264 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 GRIA3P42263 894 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 BEX3Q00994 111 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 MCEMP1Q8IX19 187 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 MYPNQ86TC9 1320 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 SMIM11AP58511 58 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 CDC42P60953 191 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
LAMC1-201ENST00000258341 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms