RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 I6L893 689 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 TRPA1O75762 1119 aa24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 CDK4P11802 303 aa24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 GABRB3P28472 473 aa24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 NOS2P35228 1153 aa24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 NR1H2P55055 460 aa24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 PRKCZQ05513 592 aa24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 USP10Q14694 798 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 KDM1BQ8NB78 822 aa24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 PADI4Q9UM07 663 aa24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 RNF11Q9Y3C5 154 aa24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 CEPT1Q9Y6K0 416 aa24.98■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 MAGEB16A2A368 324 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 KPNA6O60684 536 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 NFKB1P19838 968 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 CAP1Q01518 475 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 CEP350Q5VT06 3117 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 TRIM38O00635 465 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 BEST1O76090 585 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 HADHAP40939 763 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 NPY2RP49146 381 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 PTK2BQ14289 1009 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 MYBPC3Q14896 1274 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 NRF1Q16656 503 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 TSTD2Q5T7W7 516 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 RHOJQ9H4E5 214 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 UBP1Q9NZI7 540 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 TSC2P49815 1807 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 ARHGAP10A1A4S6 786 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 M0QZ92 97 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 XPOTO43592 962 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 TAF6P49848 677 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 ZNF460Q14592 562 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 GK5Q6ZS86 529 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 ZNF560Q96MR9 790 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 XPR1Q9UBH6 696 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 C9IYK1 514 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 PTGESO14684 152 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 FAM200BP0CF97 657 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 ASB9Q96DX5 294 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 TSNARE1Q96NA8 513 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 GPR78Q96P69 363 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 SNX25Q9H3E2 840 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 ADA2Q9NZK5 511 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-201ENST00000257818 SDHDO14521 159 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 PSMC3P17980 439 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 ADRA1BP35368 520 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 SEMA3BQ13214 749 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 SLC12A1Q13621 1099 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 SPATA6LQ8N4H0 392 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 EME1Q96AY2 570 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 PCDHAC1Q9H158 963 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 COQ10BQ9H8M1 238 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 SPC25Q9HBM1 224 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 CLDN5O00501 218 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 CHRNA1P02708 482 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 AHSGP02765 367 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 MFSD6LQ8IWD5 586 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 CCNYL1Q8N7R7 359 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 APPL2Q8NEU8 664 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 OMDQ99983 421 aa24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 BPTFQ12830 3046 aa24.94■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 SEPT4O43236 478 aa24.94■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 C8BP07358 591 aa24.94■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 ARSAP15289 507 aa24.94■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 PNPLA4P41247 253 aa24.94■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 LILRA4P59901 499 aa24.94■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 PSME3P61289 254 aa24.94■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 CYTH1Q15438 398 aa24.94■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 SH2D4BQ5SQS7 431 aa24.94■■□□□ 1.58
LMO2-201ENST00000257818 CEP97Q8IW35 865 aa24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms