RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm20878L7N244 103 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prkag1O54950 330 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mid1O70583 680 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Glb1P23780 647 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ctnna1P26231 906 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MatkP41242 505 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pth1rP41593 591 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nucb2P81117 420 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Runx2Q08775 607 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Agbl1Q09M05 972 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NeblQ0II04 452 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Emc10Q3TAS6 258 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CiartQ3TQ03 375 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc117Q6PB51 277 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf513Q6PD29 541 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nudcd1Q6PIP5 582 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Igsf3Q6ZQA6 1194 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmc6Q7TN60 810 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Elf5Q8VDK3 253 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc7a9Q9QXA6 487 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pex11bQ9Z210 259 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm13271B1AYH9 182 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arg2O08691 354 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ComtO88587 265 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cd44P15379 778 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CskP41241 450 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Opa1P58281 960 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arl4aP61213 200 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MyzapQ3UIJ9 466 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam189bQ5HZJ5 669 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Orc2Q60862 576 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Itga3Q62470 1053 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rab34Q64008 259 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ints6Q6PCM2 883 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tdpoz3Q717B4 365 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arrb1Q8BWG8 418 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wdr59Q8C0M0 992 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cadm1Q8R5M8 456 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr45Q8VGM1 311 aa21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Usp51B1AY15 661 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm13285B1AYI3 182 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm13275B1AYI8 182 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm6576F6YTZ4 274 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3182K7N6T8 263 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3159K7N760 267 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atxn2O70305 1285 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ArafP04627 604 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ZfaP23607 742 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fgf11P70378 225 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc38a5Q3U1J0 479 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lsmem1Q3UQS2 128 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AcrbpQ3V140 540 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Clec4a4Q5YIR8 236 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nxph1Q61200 271 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dpysl3Q62188 570 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hmgxb4Q80Y32 594 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf187Q8BFX1 236 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cox14Q8BH51 57 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 IfnzQ8BQT1 182 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm13278Q8CD73 182 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sh2d5Q8JZW5 429 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf668Q8K2R5 619 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Erlec1Q8VEH8 483 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr697Q8VFM4 317 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kdelr1Q99JH8 212 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PdiltQ9DAN1 588 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ReckQ9Z0J1 971 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mast4Q811L6 2618 aa21.93■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp407G3UVV3 2246 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm10800D3Z496 220 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr414E9Q5P8 317 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mapkapk2P49138 386 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tle3Q08122 772 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Faf2Q3TDN2 445 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Med16Q6PGF3 828 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ino80cQ8BHA0 191 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hspbap1Q8BK58 483 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MdficQ8BX65 247 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NotumQ8R116 503 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Thg1lQ9CY52 298 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DynapQ9D7M5 161 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fstl3Q9EQC7 256 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Capn12Q9ER56 720 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chrna6Q9R0W9 494 aa21.92■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm14781A2A9Q9 366 aa21.91■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ssxb9A2BI93 185 aa21.91■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pex5O09012 639 aa21.91■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nek2O35942 443 aa21.91■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 P01657 111 aa21.91■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MsnP26041 577 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RxrgP28705 463 aa21.91■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il12bP43432 335 aa21.91■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mageb5Q14AN0 366 aa21.91■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam8a1Q3URQ4 399 aa21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.9 ms