RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trip10Q8CJ53 603 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gemin2Q9CQQ4 269 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rin2Q9D684 903 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clca1Q9D7Z6 913 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znrf4Q9DAH2 327 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ralgps2Q9ERD6 590 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nlrp12E9Q5R7 1054 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcl7cO08664 217 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp2j6O54750 501 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam167bP17257 162 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mthfd2P18155 350 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adra2bP30545 450 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sap25Q1EHW4 186 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam35aQ3UEN2 891 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr20Q7TRX9 314 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smoc2Q8CD91 447 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adprhl2Q8CG72 370 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wnt9aQ8R5M2 365 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trmt11Q9CWH5 460 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930524N10RikQ9D519 233 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc175E9PVB3 822 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01740 135 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cage1Q5IR70 849 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubxn7Q6P5G6 467 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bnip1Q6QD59 228 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam120bQ6RI63 786 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tigd3Q7TM95 470 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sel1l3Q80TS8 1137 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpp38Q80UU2 280 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ipo11Q8K2V6 975 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem135Q9CYV5 458 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SgshQ9EQ08 502 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cul3Q9JLV5 768 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zscan5bB2RTN3 468 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr652B9EHE6 318 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp2b23E9Q593 491 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r76F8VQ63 324 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kbtbd2G3X9X1 623 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1022L7MTT3 315 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Limk2O54785 638 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PcnaP17918 261 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp6v1b2P62814 511 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc74bQ14BP6 391 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrn4clQ3TYX2 239 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KizQ3UXL4 695 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 9930111J21Rik1Q5SVP0 844 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcna4Q61423 654 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dok4Q99KE3 325 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CinpQ9D0V8 212 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem80Q9D3H0 123 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plin3Q9DBG5 437 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map7d3A2AEY4 876 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lcn6A2AJB9 181 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kctd18E0CZ26 429 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc9a3G3X939 829 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Enpp1P06802 906 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MutP16332 748 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdha1P35486 390 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lhx3P50481 400 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fzd6Q61089 709 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RadilQ69Z89 1099 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdc14bQ6PFY9 485 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cfap97Q6ZPR1 541 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1062Q7TR71 315 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kansl2Q8BQR4 486 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clec1aQ8BWY2 269 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tbc1d22aQ8R5A6 516 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mark1Q8VHJ5 795 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gprc5bQ923Z0 410 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dock3Q8CIQ7 2027 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm12248A0A1W2P8B8 313 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcng1A2BDX4 514 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf518bB2RRE4 1077 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pate1E9Q658 125 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spata31E9QAF0 1014 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp275G3X904 499 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppm1aP49443 382 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ctps2P70303 586 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tial1P70318 392 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdh6P97326 790 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dlx3Q64205 287 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lingo3Q6GQU6 589 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Elmo2Q8BHL5 732 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mpp7Q8BVD5 576 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ephb1Q8CBF3 984 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nle1Q8VEJ4 485 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Setd7Q8VHL1 366 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GabrqQ9JLF1 638 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Homer2Q9QWW1 354 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam166bA2AIP0 273 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r74E9PW21 853 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Oaz2O08608 189 aa21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.6 ms