RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Uroc1Q8VC12 676 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 B3galt6Q91Z92 325 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nme5Q99MH5 211 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Htra3Q9D236 459 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MispQ9D279 648 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ropn1Q9ESG2 212 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Scube2Q9JJS0 997 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tcea2Q9QVN7 299 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Actl7bQ9QY83 418 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FarsbQ9WUA2 589 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slfn14V9GXG1 899 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sptbn1Q62261 2363 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ncor2Q9WU42 2472 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ap1arE9PYF7 298 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm7995L7N2E4 160 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hoxc11P31313 304 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FynP39688 537 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rph3aP47708 681 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Jak1P52332 1153 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Agxt2Q3UEG6 513 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CamkvQ3UHL1 512 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttyh3Q6P5F7 524 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mbtd1Q6P5G3 631 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc29Q80VM3 471 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krr1Q8BGA5 380 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dars2Q8BIP0 653 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Qsox1Q8BND5 748 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc16Q8C1F5 767 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q8C4P0 716 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem154Q8C4Q9 181 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam78aQ8C552 283 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rfx6Q8C7R7 927 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Crlf2Q8CII9 359 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1361Q8VFH0 317 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MgarpQ8VI64 283 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp266E9Q2S7 604 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prdm14E9Q3T6 561 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FancfE9Q5Z5 343 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccl26F8VQM2 93 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Top3aO70157 1003 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hoxc8P09025 242 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rab6bP61294 208 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppp3caP63328 521 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mfsd14aP70187 490 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Coq7P97478 217 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxw2Q60584 422 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Jak2Q62120 1129 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 HpseQ6YGZ1 535 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q80Y73 168 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Aifm2Q8BUE4 373 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 A430089I19RikQ8C9W1 407 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rab30Q923S9 203 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TcimQ9D915 106 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 EqtnQ9D9V2 337 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ParvbQ9ES46 365 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rfx5Q9JL61 658 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm2237E9Q501 211 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3591K7N6X2 186 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Psmc3O88685 442 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GcP21614 476 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dlg3P70175 849 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ndrg1Q62433 394 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr212Q7TS33 327 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam109aQ8BH49 266 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sphk1Q8CI15 382 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mlc1Q8VHK5 382 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stk33Q924X7 491 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgap8Q9CXP4 425 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp623Q9CY99 499 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mmp19Q9JHI0 527 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sertad2Q9JJG5 309 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fut2Q9JL27 347 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 St6galnac1Q9QZ39 526 aa9.05□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 6030498E09RikB1AX85 169 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klhl4B1AZR0 717 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc62E9PVD1 701 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxl18E9PYR1 771 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm7694J3QNH8 270 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfm1O88998 485 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Odc1P00860 461 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chrna1P04756 457 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mcpt1P11034 246 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Oas1aP11928 367 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdc25bP30306 576 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tap2P36371 702 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccr5P51682 354 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arf4P61750 180 aa9.04□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rad54lP70270 747 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.9 ms