RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 RGRP47804 291 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 NPY2RP49146 381 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC14A2Q15849 920 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 DENND5AQ6IQ26 1287 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 EP400NLQ6ZTU2 488 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 FSD1LQ9BXM9 530 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 PLAC1Q9HBJ0 212 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 TMBIM4Q9HC24 238 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SYBUQ9NX95 663 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 BFARQ9NZS9 450 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 OGFRQ9NZT2 677 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 GGA2Q9UJY4 613 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO10Q9UK96 956 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 DOCK8Q8NF50 2099 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 MT-CO1P00395 513 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTA2P09210 222 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CES1P23141 567 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CRADDP78560 199 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 FUT11Q495W5 492 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNJLQ8IV13 435 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM83CQ9BQN1 747 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 LHX3Q9UBR4 397 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ADH1CP00326 375 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 MYZAPP0CAP1 466 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ADH5P11766 374 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 IGFBP4P22692 258 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC20A2Q08357 652 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 PCSK7Q16549 785 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT71Q3SY84 523 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 VITQ6UXI7 678 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC5AQ6ZN44 842 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CROCCP2Q86T23 111 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL8AQ96BM9 186 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP36Q96G28 342 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFYVE19Q96K21 471 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC77Q9BR77 488 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 NAT9Q9BTE0 207 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ARNT2Q9HBZ2 717 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 RABGEF1Q9UJ41 708 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 INSIG1O15503 277 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 NFATC1O95644 943 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINF2P08697 491 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMP2P13473 410 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ARSAP15289 507 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 FCHO2Q0JRZ9 810 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 DMC1Q14565 340 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CERCAMQ5T4B2 595 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 STEAP4Q687X5 459 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD6LQ8IWD5 586 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT222Q8N1A0 295 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 FBF1Q8TES7 1133 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOC2Q96KP1 924 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDCD1Q96RS6 583 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 IL22Q9GZX6 179 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 POMKQ9H5K3 350 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 NOD2Q9HC29 1040 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA6L10A6NI86 522 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8KD6RF30 607 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 RASGRF2O14827 1237 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 PGAM1P18669 254 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SCNN1BP51168 640 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 PDGFRLQ15198 375 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 LONRF1Q17RB8 773 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CASC4Q6P4E1 433 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 NAT16Q8N8M0 369 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SMRP1Q8NCR6 262 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP2A3Q93084 1043 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 NSMCE3Q96MG7 304 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 EBF3Q9H4W6 596 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSS3Q9H6R3 686 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 K7ERQ8 282 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TPH1P17752 444 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TTMPQ5BVD1 217 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 KDELC2Q7Z4H8 507 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ADIPOR2Q86V24 386 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ELSPBP1Q96BH3 223 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 FEM1CQ96JP0 617 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa25.19■■□□□ 1.62
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