RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.39■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 KCNH1O95259 989 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 FMO1Q01740 532 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 DEC1Q9P2X7 70 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 ADRA1DP25100 572 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 SERPINB1P30740 379 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 CDK18Q07002 472 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 TAF10Q12962 218 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 ADRM1Q16186 407 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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