RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 PEBP4Q96S96 227 aa20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-211ENST00000589631 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-211ENST00000589631 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-211ENST00000589631 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-211ENST00000589631 KLC2Q9H0B6 622 aa20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-211ENST00000589631 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-211ENST00000589631 LRRC19Q9H756 370 aa20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-211ENST00000589631 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-211ENST00000589631 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-211ENST00000589631 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-211ENST00000589631 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 LRCH4O75427 683 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 PCDH8O95206 1070 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 GYPCP04921 128 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 TPM3P06753 285 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 PCK1P35558 622 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 HCAR3P49019 387 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 CA9Q16790 459 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 OXR1Q8N573 874 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 RAB7BQ96AH8 199 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 VOPP1Q96AW1 172 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 FEM1CQ96JP0 617 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.51■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 KRIT1O00522 736 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 SLC31A1O15431 190 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 TMCC1O94876 653 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 RXRGP48443 463 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 RAD51Q06609 339 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 SHBQ15464 509 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 INAVAQ3KP66 663 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.5■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 A0A087X0T9 212 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 FAM228BP0C875 321 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 SPINK2P20155 84 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 GKP32189 559 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 RHOAP61586 193 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 RFX8Q6ZV50 586 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 FAM174AQ8TBP5 190 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 SAP25Q8TEE9 199 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 KLHDC7BQ96G42 594 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 THAP2Q9H0W7 228 aa20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 DAPK3O43293 454 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 TNFSF14O43557 240 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 TSPAN6O43657 245 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 IGSF6O95976 241 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 PRLRP16471 622 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 ERCC2P18074 760 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 AKT2P31751 481 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 CASP14P31944 242 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 IL9RQ01113 521 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 CYTH1Q15438 398 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 BOLA3Q53S33 107 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 AFMIDQ63HM1 303 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 KLK6Q92876 244 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.48■□□□□ 0.87
GIPC1-211ENST00000589631 PDFQ9HBH1 243 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.4 ms