RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589254.1

USP36-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 3

Gene USP36, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-215	ENST00000589254	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	CLEC14A	Q86T13	490 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	IQCH	Q86VS3	1027 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	TRIM69	Q86WT6	500 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	PASD1	Q8IV76	773 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	LATS1	O95835	1130 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ASL	P04424	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	FYN	P06241	537 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	CTSL	P07711	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	VDR	P11473	427 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	LCP1	P13796	627 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	HGF	P14210	728 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	IRAK1	P51617	712 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	VAV2	P52735	878 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	DAOA	P59103	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ECT2L	Q008S8	904 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	CENPC	Q03188	943 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	STIL	Q15468	1287 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	NAA35	Q5VZE5	725 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	VASH2	Q86V25	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	NOTCH2	Q04721	2471 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254		A0A1W2PQU0	124 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	RAD51B	O15315	384 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	GP1BA	P07359	652 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	GP1BB	P13224	206 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	CR2	P20023	1033 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	TBX4	P57082	545 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	FGL2	Q14314	439 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ZNF284	Q2VY69	593 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	KIAA1328	Q86T90	577 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	CEP83	Q9Y592	693 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
USP36-215	ENST00000589254	FAM170A	A1A519	330 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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