RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 EXTL3O43909 919 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 RFPL2O75678 378 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 B3GAT3O94766 335 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 HAUS5O94927 633 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 OAZ2O95190 189 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 GCNT3O95395 438 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 WEE2P0C1S8 567 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 TYRP14679 529 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 IDEP14735 1019 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 LIG4P49917 911 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 ALCAMQ13740 583 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 AAK1Q2M2I8 961 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 ANO6Q4KMQ2 910 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 C1orf220Q5T0J3 134 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 LCE3BQ5TA77 95 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 FAM171A1Q5VUB5 890 aa5.1□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 C9orf57Q5W0N0 161 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 JADE1Q6IE81 842 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 KRBA2Q6ZNG9 492 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 Q6ZRM9 215 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 GPR149Q86SP6 731 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 CBWD2Q8IUF1 395 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 BRSK2Q8IWQ3 736 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 ADHFE1Q8IWW8 467 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 C12orf56Q8IXR9 622 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 FSIP1Q8NA03 581 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 BEST2Q8NFU1 509 aa5.1□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 SLC35A4Q96G79 324 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 ACCSQ96QU6 501 aa5.1□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 TTPALQ9BTX7 342 aa5.1□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa5.1□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 FBXW11Q9UKB1 542 aa5.1□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 CASP10Q92851 521 aa5.09□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.09□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 BICD1Q96G01 975 aa5.09□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 TSPAN18Q96SJ8 248 aa5.09□□□□□ -1.59
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