RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 AP1G1O43747 822 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CUTAO60888 179 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 AGFG2O95081 481 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CALCAP01258 141 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRR29P0C7W0 189 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ITGB7P26010 798 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 L1CAMP32004 1257 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGFALSP35858 605 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 MLLT10P55197 1068 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 AUHQ13825 339 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 C16orf72Q14CZ0 275 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 TCEA2Q15560 299 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CNGA2Q16280 664 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 LVRNQ6Q4G3 990 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINGO4Q6UY18 593 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 BEND5Q7L4P6 421 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCNJLQ8IV13 435 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLITRK4Q8IW52 837 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 DENND6BQ8NEG7 585 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ASB12Q8WXK4 309 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ABHD17AQ96GS6 310 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPP1R16AQ96I34 528 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 B3GNT4Q9C0J1 378 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 MUC3BQ9H195 1237 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 TNKS2Q9H2K2 1166 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 VPS51Q9UID3 782 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 GGT7Q9UJ14 662 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 VANGL2Q9ULK5 521 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNF215Q9Y6U7 377 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CSMD1Q96PZ7 3565 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 M0QYT0 321 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ENDOD1O94919 500 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNF224P0DH78 156 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCL4P13236 92 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 UQCRFS1P47985 274 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPL34P49207 117 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATP1A2P50993 1020 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 YPEL5P62699 121 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRT83P78385 493 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPARDQ03181 441 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ADAM9Q13443 819 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ELOCQ15369 112 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CBWD6Q4V339 395 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CBWD3Q5JTY5 395 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CBWD5Q5RIA9 395 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 PHF19Q5T6S3 580 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM164Q5U3C3 297 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF787Q6DD87 383 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 C22orf39Q6P5X5 142 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 MACC1Q6ZN28 852 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZSCAN30Q86W11 494 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL22RA1Q8N6P7 574 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPR156Q8NFN8 814 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR6C4Q8NGE1 309 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 PMEPA1Q969W9 287 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CATSPER2Q96P56 530 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 EPAS1Q99814 870 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 EDEM3Q9BZQ6 932 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 SEMA6CQ9H3T2 930 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 SERTAD1Q9UHV2 236 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 APPL1Q9UKG1 709 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPR34Q9UPC5 381 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 MTMR6Q9Y217 621 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 COQ4Q9Y3A0 265 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 SHANK1Q9Y566 2161 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRR19A6NJB7 356 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 NKX2-8O15522 239 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 TSPAN6O43657 245 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CLDN11O75508 207 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CNTN5O94779 1100 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRT7P08729 469 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 PAEPP09466 180 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ALPIP09923 528 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 UGT1A3P35503 534 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 GGCXP38435 758 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 ABL2P42684 1182 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CLCN6P51797 869 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 HK3P52790 923 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 KLRB1Q12918 225 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 CUL4AQ13619 759 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 C5orf22Q49AR2 442 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 FHL5Q5TD97 284 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM270Q6UE05 265 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 NYAP1Q6ZVC0 841 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDNEP1-202ENST00000570380 SPRED1Q7Z699 444 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms