RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	DOCK1	Q14185	1865 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM38	O00635	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PCDH17	O14917	1159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DNPH1	O43598	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	EXOC3	O60645	756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TJP3	O95049	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ANXA6	P08133	673 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	NPPB	P16860	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DRD1	P21728	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CALML3	P27482	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GNA11	P29992	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	OAZ1	P54368	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CYP4F2	P78329	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	COL10A1	Q03692	680 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	WDR24	Q96S15	920 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	OTOF	Q9HC10	1997 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FCHO1	O14526	889 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SUV39H1	O43463	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINF1	P36955	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	HAL	P42357	657 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DIO1	P49895	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	HSD17B4	P51659	736 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	LMAN2	Q12907	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TRAF1	Q13077	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	BFSP2	Q13515	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CUL5	Q93034	780 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PORCN	Q9H237	461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ABCB11	O95342	1321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RLF	Q13129	1914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934		A8MVJ9	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934		M0R3H8	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ACKR2	O00590	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms