RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557454.1

NEDD1-211, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-211ENST00000557454 ZBED1O96006 694 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 IGLV3-27P01718 113 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 GAP43P17677 238 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 PTGER4P35408 488 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 UBA7P41226 1012 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 SULT2A1Q06520 285 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 NCOA4Q13772 614 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 ARHGEF7Q14155 803 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 LINGO4Q6UY18 593 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 MACC1Q6ZN28 852 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 PIGZQ86VD9 579 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 HID1Q8IV36 788 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 RANBP9Q96S59 729 aa9.59□□□□□ -0.87
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NEDD1-211ENST00000557454 EDEM3Q9BZQ6 932 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 SPRY4Q9C004 299 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 LRIT1Q9P2V4 623 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD1-211ENST00000557454 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 CDC14CA4D256 554 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 IGLON5A6NGN9 336 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 SLC26A4O43511 780 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 ZG16O60844 167 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 PPP6R2O75170 966 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 FAM155BO75949 473 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 CTSEP14091 401 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 PNLIPP16233 465 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 CHRNA3P32297 505 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 CLCN1P35523 988 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 IGFALSP35858 605 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 STAT5AP42229 794 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 ASPAP45381 313 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 CASP4P49662 377 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 TKTL1P51854 596 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 HK3P52790 923 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 OR1D5P58170 312 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 B4GALNT1Q00973 533 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 SGCGQ13326 291 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 ALCAMQ13740 583 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 SMTNL2Q2TAL5 461 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 MS4A13Q5J8X5 152 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 RAB41Q5JT25 222 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 SPOPLQ6IQ16 392 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 CDH24Q86UP0 819 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 GKN2Q86XP6 184 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 UNC45BQ8IWX7 931 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 RTP4Q96DX8 246 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 FEM1CQ96JP0 617 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 CTRCQ99895 268 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 HDAC8Q9BY41 377 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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NEDD1-211ENST00000557454 SLC25A13Q9UJS0 675 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 ACANP16112 2415 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 JMJD1CQ15652 2540 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 A6NCN8 305 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 B4DGG1 531 aa9.57□□□□□ -0.88
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NEDD1-211ENST00000557454 P4HA1P13674 534 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 IDEP14735 1019 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 MPSTP25325 297 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 ITGA3P26006 1051 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 BLKP51451 505 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 NEK3P51956 506 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 RAB15P59190 212 aa9.57□□□□□ -0.88
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NEDD1-211ENST00000557454 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 ANKRD1Q15327 319 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 ALG11Q2TAA5 492 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 BSPRYQ5W0U4 402 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD1-211ENST00000557454 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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