RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556705.5

SRP54-AS1-204, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 580 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NDST2P52849 883 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCDC15Q0P6D6 951 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FOXC1Q12948 553 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ACAP1Q15027 740 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CYTH1Q15438 398 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RFX8Q6ZV50 586 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HORMAD1Q86X24 394 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPP1R16AQ96I34 528 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NCAPGQ9BPX3 1015 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NUP85Q9BW27 656 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DMTF1Q9Y222 760 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CA5BQ9Y2D0 317 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa13.45□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C16orf96A6NNT2 1141 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TLR4O00206 839 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC31A1O15431 190 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DAPK3O43293 454 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PCDH8O95206 1070 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PRLRP16471 622 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NUDT1P36639 197 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HCAR3P49019 387 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RHOAP61586 193 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IL9RQ01113 521 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SMTNL2Q2TAL5 461 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF284Q2VY69 593 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AFMIDQ63HM1 303 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NEK5Q6P3R8 708 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FBXL19Q6PCT2 694 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 VSTM4Q8IW00 320 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MFSD2AQ8NA29 543 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR8K1Q8NGG5 319 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SKA1Q96BD8 255 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LRIG1Q96JA1 1093 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KLHL32Q96NJ5 620 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DNAJC7Q99615 494 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZWILCHQ9H900 591 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PDFQ9HBH1 243 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LHX3Q9UBR4 397 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ANAPC7Q9UJX3 599 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 WASF3Q9UPY6 502 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BTBD3Q9Y2F9 522 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FADS3Q9Y5Q0 445 aa13.44□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PTPRBP23467 1997 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 A0A1B0GTQ1 180 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARHGAP42A6NI28 874 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 INSIG1O15503 277 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PRAMEF11O60813 436 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UGT2B4P06133 528 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RARAP10276 462 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPINK2P20155 84 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ABL2P42684 1182 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCT8P50990 548 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ADKP55263 362 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NXPH1P58417 271 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SHC2P98077 582 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DPYSQ14117 519 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRIM14Q14142 442 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 STAT4Q14765 748 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SHBQ15464 509 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DPYSL2Q16555 572 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMEM259Q4ZIN3 620 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BOLA3Q53S33 107 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC45A4Q5BKX6 768 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF805Q5CZA5 627 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GDPD4Q6W3E5 623 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CPNE8Q86YQ8 564 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TP53INP2Q8IXH6 220 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NPWQ8N729 165 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NIPA2Q8N8Q9 360 aa13.43□□□□□ -0.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms