RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550155.5

CNOT2-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2

Gene CNOT2, Length 842 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-222	ENST00000550155	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CSF1	P09603	554 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MXI1	P50539	228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	PRKAA2	P54646	552 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	TRAF3	Q13114	568 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	NR4A3	Q92570	626 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	LINC01565	O15544	149 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MYF6	P23409	242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CUL4B	Q13620	913 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MORC3	Q14149	939 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	RNF183	Q96D59	192 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	KRT36	O76013	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SERPINC1	P01008	464 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	LPIN1	Q14693	890 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64	2e-6	■■□□□ 12
CNOT2-222	ENST00000550155	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	IL25	Q9H293	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	DERA	Q9Y315	318 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	BUB3	O43684	328 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CH25H	O95992	272 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	DCTD	P32321	178 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ADD2	P35612	726 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	PTPN9	P43378	593 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	BNC1	Q01954	994 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	PRKG1	Q13976	671 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	RPE65	Q16518	533 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ME3	Q16798	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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