RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CUL5	Q93034	780 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RFK	Q969G6	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PBK	Q96KB5	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356		A0A087WWL8	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	KLK10	O43240	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PPP6R2	O75170	966 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ACVR2A	P27037	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PCSK1	P29120	753 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	AKT1	P31749	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	MSH2	P43246	934 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SLC11A2	P49281	568 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	AMPH	P49418	695 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RAD23A	P54725	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RBP5	P82980	135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	BFSP1	Q12934	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	MTM1	Q13496	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PPA1	Q15181	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SEC23B	Q15437	767 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356		Q4G0T1	1027 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SCML4	Q8N228	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PIGS	Q96S52	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RAB27B	O00194	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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