RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518141.1

CPEB4-204, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, human

TSL 3

Gene CPEB4, Length 429 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB4-204	ENST00000518141	CKMT1A	P12532	417 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	MTNR1A	P48039	350 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	BUB3	O43684	328 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	MYF6	P23409	242 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	DCTD	P32321	178 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	PDCL	Q13371	301 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	RPE65	Q16518	533 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	PKP4	Q99569	1192 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	HBP1	O60381	514 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	CBX6	O95503	412 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	IL1A	P01583	271 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	SERPINB3	P29508	390 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	SNTA1	Q13424	505 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	BLMH	Q13867	455 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	BICD1	Q96G01	975 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	BMPR1B	O00238	502 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	UMOD	P07911	640 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	FMO4	P31512	558 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	CENPA	P49450	140 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	MYBPH	Q13203	477 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	LPIN1	Q14693	890 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	GAGE7	O76087	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	VNN2	O95498	520 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	CH25H	O95992	272 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	SERPINC1	P01008	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	CSF1	P09603	554 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	DLG1	Q12959	904 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	GAGE1	Q13065	139 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	GAGE4	Q13068	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	NAGS	Q8N159	534 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPEB4-204	ENST00000518141	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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