RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517215.1

RNU6-1238P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1238, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1238P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TNFSF8P32971 234 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RDXP35241 583 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAPK9P45984 424 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ID4P47928 161 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GPM6AP51674 278 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 MGAT2Q10469 447 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GALNT2Q10471 571 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 GAGE6Q13070 117 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NR1D2Q14995 579 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SEPT2Q15019 361 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SS18Q15532 418 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TAF9Q16594 264 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ALG10Q5BKT4 473 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ALG10BQ5I7T1 473 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KCTD8Q6ZWB6 473 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CYB5R4Q7L1T6 521 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 MKXQ8IYA7 352 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAM169BQ8N8A8 192 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGSF22Q8N9C0 903 aa-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 TANKQ92844 425 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GJA10Q969M2 543 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ELSPBP1Q96BH3 223 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LRRC58Q96CX6 371 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 WDYHV1Q96HA8 205 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMEM19Q96HH6 336 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GFI1Q99684 422 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MTMR12Q9C0I1 747 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GREM2Q9H772 168 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FKRPQ9H9S5 495 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 EXD2Q9NVH0 621 aa-0.69□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 NEURL1O76050 574 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 EML2O95834 649 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CLPTM1O96005 669 aa-0.7□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 ANGP03950 147 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa-0.7□□□□□ -2.52
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 HLA-DOBP13765 273 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CELP19835 753 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PTPN3P26045 913 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CHRNA3P32297 505 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CYP2C19P33261 490 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MCM5P33992 734 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CHRNA7P36544 502 aa-0.7□□□□□ -2.52
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