RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 RRN3Q9NYV6 651 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB26Q9ULW5 256 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHGB4Q9UN71 923 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMD3O43242 534 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 TREHO43280 583 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 CACNG3O60359 315 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 PGK1P00558 417 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 SRGAP2BP0DMP2 458 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 TSTD2Q5T7W7 516 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 PM20D1Q6GTS8 502 aa27.42■■□□□ 1.98
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SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 TCAF2A6NFQ2 919 aa27.41■■□□□ 1.98
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SH3BP2-221ENST00000511747 TICAM1Q8IUC6 712 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.984e-7■□□□□ 9.8
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SH3BP2-221ENST00000511747 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa27.41■■□□□ 1.98
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SH3BP2-221ENST00000511747 ARNTP27540 789 aa27.4■■□□□ 1.98
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SH3BP2-221ENST00000511747 CATSPER1Q8NEC5 780 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF34Q969K3 372 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 NDUFA13Q9P0J0 144 aa27.4■■□□□ 1.98
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SH3BP2-221ENST00000511747 EPB41L1Q9H4G0 881 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 LZTS1Q9Y250 596 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAH12Q6ZR08 3092 aa27.39■■□□□ 1.97
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SH3BP2-221ENST00000511747 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-221ENST00000511747 TRPC5OSA6NMA1 111 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-221ENST00000511747 NPHS1O60500 1241 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-221ENST00000511747 CCNCP24863 283 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC1A2P43004 574 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-221ENST00000511747 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM67Q6ZTA4 783 aa27.37■■□□□ 1.97
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