RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 OR5K4A6NMS3 321 aa7.39□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 C9orf172C9J069 976 aa7.39□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 MYO1CO00159 1063 aa7.39□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 DYNC1I1O14576 645 aa7.39□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PRRG1O14668 218 aa7.39□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 KLK10O43240 276 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDCD4-211ENST00000498367 ERLIN2O94905 339 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDCD4-211ENST00000498367 GRTP1Q5TC63 336 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDCD4-211ENST00000498367 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDCD4-211ENST00000498367 YES1P07947 543 aa7.38□□□□□ -1.23
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PDCD4-211ENST00000498367 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CYP2A7P20853 494 aa7.38□□□□□ -1.23
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PDCD4-211ENST00000498367 SFNP31947 248 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 OTX2P32243 289 aa7.38□□□□□ -1.23
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PDCD4-211ENST00000498367 CTNNB1P35222 781 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SPAM1P38567 509 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CDKN1BP46527 198 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 OAZ1P54368 228 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CDH8P55286 799 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NME5P56597 212 aa7.38□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 RAB14P61106 215 aa7.38□□□□□ -1.23
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