RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490566.1

TNS1-217, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-217ENST00000490566 MAPKAPK2P49137 400 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TUFMP49411 452 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SERPINB8P50452 374 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 MPP3Q13368 585 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 C5orf22Q49AR2 442 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 PCID2Q5JVF3 399 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 PDPK2PQ6A1A2 396 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TEX26Q8N6G2 289 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 FITM2Q8N6M3 262 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 MYEOVQ96EZ4 313 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 CLSTN3Q9BQT9 956 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SP110Q9HB58 689 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 CHRAC1Q9NRG0 131 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TXNDC16Q9P2K2 825 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 HSFX1Q9UBD0 423 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 EMCNQ9ULC0 261 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TCAF1Q9Y4C2 921 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ALPK3Q96L96 1907 aa10.51□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 J3KR12 359 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TNFRSF10AO00220 468 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 BIRC5O15392 142 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 LILRA1O75019 489 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 NEBLO76041 1014 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 BPGMP07738 259 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SPRP35270 261 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 RENBPP51606 427 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 NCALDP61601 193 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 IL10RBQ08334 325 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 PARP15Q460N3 678 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ARMC3Q5W041 872 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 PKN3Q6P5Z2 889 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 STRA8Q7Z7C7 330 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SLC39A11Q8N1S5 342 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 DCLK2Q8N568 766 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 AGAP2Q99490 1192 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 MECRQ9BV79 373 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ATP13A1Q9HD20 1204 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 NPHS2Q9NP85 383 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 NT5MQ9NPB1 228 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 GGT7Q9UJ14 662 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 DNMT3LQ9UJW3 386 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 CHKBQ9Y259 395 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 YIPF1Q9Y548 306 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 BRCA2P51587 3418 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 F5H5T6 163 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 C2CD2LO14523 706 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ACSL4O60488 711 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 PLIN3O60664 434 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 RAMP2O60895 175 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 PMPCBO75439 489 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 DCTN3O75935 186 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ABLIM3O94929 683 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TGDSO95455 350 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 CLTBP09497 229 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 KCNQ1P51787 676 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 WNT3AP56704 352 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 PDE1BQ01064 536 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 DSG1Q02413 1049 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 BNIP1Q12981 228 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 SERINC3Q13530 473 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 POU6F1Q14863 301 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 INSCQ1MX18 579 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 TPGS2Q68CL5 300 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 KLHDC10Q6PID8 442 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 RANBP10Q6VN20 620 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 LGI2Q8N0V4 545 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 RFWD2Q8NHY2 731 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 PSMG2Q969U7 264 aa10.5□□□□□ -0.73
TNS1-217ENST00000490566 AZIN2Q96A70 460 aa10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms