RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.3□□□□□ -0.92
SYN3-211ENST00000472027 NUP205Q92621 2012 aa9.3□□□□□ -0.92
SYN3-211ENST00000472027 FAM186AA6NE01 2351 aa9.3□□□□□ -0.92
SYN3-211ENST00000472027 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.29□□□□□ -0.92
SYN3-211ENST00000472027 PIEZO1Q92508 2521 aa9.29□□□□□ -0.92
SYN3-211ENST00000472027 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.29□□□□□ -0.92
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SYN3-211ENST00000472027 STAT4Q14765 748 aa9.28□□□□□ -0.92
SYN3-211ENST00000472027 PDK2Q15119 407 aa9.28□□□□□ -0.92
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SYN3-211ENST00000472027 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.28□□□□□ -0.92
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SYN3-211ENST00000472027 DMTF1Q9Y222 760 aa9.28□□□□□ -0.92
SYN3-211ENST00000472027 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.28□□□□□ -0.92
SYN3-211ENST00000472027 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
SYN3-211ENST00000472027 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 CHD5Q8TDI0 1954 aa9.27□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.27□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.27□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.27□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 GIPC1O14908 333 aa9.27□□□□□ -0.93
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