RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471538.1

SPEN-204, Transcript of spen family transcriptional repressor, humanhuman

TSL 2

Gene SPEN, Length 1,404 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEN-204ENST00000471538 CASD1Q96PB1 797 aa6.51□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.51□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 GPR22Q99680 433 aa6.51□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.51□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.51□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.51□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.51□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.51□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 SIK2Q9H0K1 926 aa6.51□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.51□□□□□ -1.37
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SPEN-204ENST00000471538 UBP1Q9NZI7 540 aa6.51□□□□□ -1.37
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SPEN-204ENST00000471538 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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SPEN-204ENST00000471538 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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SPEN-204ENST00000471538 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ZNF358Q9NW07 568 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 COMMD8Q9NX08 183 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 MPP6Q9NZW5 540 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.5□□□□□ -1.37
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