RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	CCL26	Q9Y258	94 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	MAGEB16	A2A368	324 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41	6e-8	■■□□□ 14.3
HDLBP-231	ENST00000467435	SNAP91	O60641	907 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	SPAG7	O75391	227 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	GJB3	O75712	270 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	CEBPB	P17676	345 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	NMBR	P28336	390 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	CHRNA4	P43681	627 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	SERPINB9	P50453	376 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	USP4	Q13107	963 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	POU6F1	Q14863	301 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB30	Q15771	203 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	DUSP6	Q16828	381 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	PCID2	Q5JVF3	399 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	POTEH	Q6S545	545 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	RANBP10	Q6VN20	620 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	MGARP	Q8TDB4	240 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	CENPT	Q96BT3	561 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	MFSD3	Q96ES6	412 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	ABHD8	Q96I13	439 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	FEM1C	Q96JP0	617 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	PSKH2	Q96QS6	385 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	KIFC1	Q9BW19	673 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	TLE6	Q9H808	572 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	PIDD1	Q9HB75	910 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	VPS28	Q9UK41	221 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDLBP-231	ENST00000467435	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC78	A2IDD5	438 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF197	O14709	1029 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT37	O76014	449 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT38	O76015	456 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PRAMEF12	O95522	483 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MT-ND3	P03897	115 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CYBB	P04839	570 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ERVK-10	P10266	1014 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	NRIP1	P48552	1158 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	BMPR2	Q13873	1038 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SEPT6	Q14141	434 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	IHH	Q14623	411 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CYTH1	Q15438	398 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC14A2	Q15849	920 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF77	Q15935	545 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MPP7	Q5T2T1	576 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	LGSN	Q5TDP6	509 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ARMC3	Q5W041	872 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	LINGO4	Q6UY18	593 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PACS1	Q6VY07	963 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNMB4	Q86W47	210 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RIN3	Q8TB24	985 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ING5	Q8WYH8	240 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MTBP	Q96DY7	904 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	IFT43	Q96FT9	208 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	EXOC2	Q96KP1	924 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TDP1	Q9NUW8	608 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PLK2	Q9NYY3	685 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ZFAT	Q9P243	1243 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	VPS51	Q9UID3	782 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MSRA	Q9UJ68	235 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	HEATR9	A2RTY3	570 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ZMPSTE24	O75844	475 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TMCC1	O94876	653 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SERPINF2	P08697	491 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT4	P19013	534 aa		12.44	□□□□□ -0.42

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