RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465894.6

SH3BP5-209, Transcript of SH3 domain binding protein 5, human

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP5-209	ENST00000465894	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	RELL1	Q8IUW5	271 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	SEMA3C	Q99985	751 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	UBP1	Q9NZI7	540 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894		E7ESA3	106 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	MUSK	O15146	869 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	ALOX15B	O15296	676 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	INSIG1	O15503	277 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	PMPCB	O75439	489 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	MT-CO1	P00395	513 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	ASL	P04424	464 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	SERPINF2	P08697	491 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	GJA4	P35212	333 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	NNMT	P40261	264 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	CD86	P42081	329 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	MAGEA4	P43358	317 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	SLC6A11	P48066	632 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	SCNN1B	P51168	640 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	RHOA	P61586	193 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	SLC14A2	Q15849	920 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	GEN1	Q17RS7	908 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	BBS9	Q3SYG4	887 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	TADA1	Q96BN2	335 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	LRRC39	Q96DD0	335 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	SERPINB12	Q96P63	405 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP5-209	ENST00000465894	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	TRIM24	O15164	1050 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	MMP2	P08253	660 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	SRC	P12931	536 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	CR2	P20023	1033 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	GRIA1	P42261	906 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	CSNK1D	P48730	415 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	NPY2R	P49146	381 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	WNT3A	P56704	352 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	SKOR1	P84550	965 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	TMEM215	Q68D42	235 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	KDELC1	Q6UW63	502 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	SRL	Q86TD4	932 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	IPMK	Q8NFU5	416 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	TTC8	Q8TAM2	541 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	TTC25	Q96NG3	672 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP5-209	ENST00000465894	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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