RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 SERINC3Q13530 473 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ACAP1Q15027 740 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 MYLK3Q32MK0 819 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PARP15Q460N3 678 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM259Q4ZIN3 620 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 SAP25Q8TEE9 199 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TRIM11Q96F44 468 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 NCAPGQ9BPX3 1015 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TM6SF2Q9BZW4 377 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KLC2Q9H0B6 622 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 LRRC19Q9H756 370 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TOR4AQ9NXH8 423 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 MSRB2Q9Y3D2 182 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 FADS3Q9Y5Q0 445 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PLXNA2O75051 1894 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 SPEGQ15772 3267 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 RASA4BC9J798 803 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 YKT6O15498 198 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 RASA4O43374 803 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TNFSF14O43557 240 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 BUB1O43683 1085 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PROS1P07225 676 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ADRB3P13945 408 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 MIPP30301 263 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 HCAR3P49019 387 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ZBED6P86452 979 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 CA9Q16790 459 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF805Q5CZA5 627 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 FBXL19Q6PCT2 694 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 OXR1Q8N573 874 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 GATA6Q92908 595 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 RAB7BQ96AH8 199 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 HMCESQ96FZ2 354 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 FEM1CQ96JP0 617 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PEBP4Q96S96 227 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TRIM7Q9C029 511 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PCSK1NQ9UHG2 260 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 AP4E1Q9UPM8 1137 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 SCINQ9Y6U3 715 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 C16orf96A6NNT2 1141 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 SLC31A1O15431 190 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 LRCH4O75427 683 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TMCC1O94876 653 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PCDH8O95206 1070 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 SERPING1P05155 500 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 C1QTNF9P0C862 333 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 GKP32189 559 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PCK1P35558 622 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TPI1P60174 286 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 RPS21P63220 83 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 CYTH1Q15438 398 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 AFMIDQ63HM1 303 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 LEKR1Q6ZMV7 388 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PNPLA1Q8N8W4 532 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 FAM174AQ8TBP5 190 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ASB12Q8WXK4 309 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF653Q96CK0 615 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KLHDC7BQ96G42 594 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 SLC17A9Q9BYT1 436 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PDFQ9HBH1 243 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KLK13Q9UKR3 277 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 FRYQ5TBA9 3013 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 KRIT1O00522 736 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 AREL1O15033 823 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 TSPAN6O43657 245 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PRPSAP2O60256 369 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 ITGAVP06756 1048 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-210ENST00000462125 PRLRP16471 622 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms