RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439079.1

LINC00415-201, long intergenic non-protein coding RNA 415, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00415, Length 435 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00415-201ENST00000439079 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SYNPO2LQ9H987 977 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 FANCEQ9HB96 536 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CHD7Q9P2D1 2997 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 MTMR6Q9Y217 621 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ITM2BQ9Y287 266 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CACNA1AO00555 2505 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 LTBP2Q14767 1821 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 FRMPD3Q5JV73 1810 aa4.86□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SYCE3A1L190 88 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 FRMD3A2A2Y4 597 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 H0YIV9 168 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 F2RL2O00254 374 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CTAGE5O15320 804 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 MAGEB3O15480 346 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 TEX33O43247 280 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 TLR2O60603 784 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ALPPP05187 535 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CELA3BP08861 270 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ALPPL2P10696 532 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CYP2C9P11712 490 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 MCM3P25205 808 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 IL15P40933 162 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ETV1P50549 477 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 STAT2P52630 851 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CAPZA1P52907 286 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CDH15P55291 814 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 OXCT1P55809 520 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 PER3P56645 1201 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CTXN1P60606 82 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ADAM17P78536 824 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SATB1Q01826 763 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 KIF5AQ12840 1032 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 NFATC3Q12968 1075 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 IRF3Q14653 427 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SSPNQ14714 243 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 PKN1Q16512 942 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 HYAL4Q2M3T9 481 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 FILIP1LQ4L180 1135 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 RNF43Q68DV7 783 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 PLAG1Q6DJT9 500 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 PRR23CQ6ZRP0 262 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 GAREM2Q75VX8 874 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 COPS6Q7L5N1 327 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SYCP3Q8IZU3 236 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SHISA5Q8N114 240 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 MPP5Q8N3R9 675 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CHST13Q8NET6 341 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 OR56A3Q8NH54 315 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 RFWD2Q8NHY2 731 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SMARCE1Q969G3 411 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 TP53INP1Q96A56 240 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 OPTNQ96CV9 577 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ALG14Q96F25 216 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 EPSTI1Q96J88 318 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ABHD1Q96SE0 405 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 MAP7D2Q96T17 732 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ACPTQ9BZG2 426 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 BCO1Q9HAY6 547 aa4.85□□□□□ -1.63
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF304Q9HCX3 659 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms