RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ANO10Q9NW15 660 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 DNAI1Q9UI46 699 aa21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM38O00635 465 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN6O43657 245 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SIGLEC6O43699 453 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 PIAS2O75928 621 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 DNA2P51530 1060 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 AIF1P55008 147 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.011e-6■■■□□ 19
LIMS1-208ENST00000428064 FGL2Q14314 439 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RTP5Q14D33 572 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF805Q5CZA5 627 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 WDR59Q6PJI9 974 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 C19orf48Q6RUI8 117 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 MON1BQ7L1V2 547 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 DENND6BQ8NEG7 585 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 BMFQ96LC9 184 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 CACNA1GO43497 2377 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 TRPM6Q9BX84 2022 aa21.34■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 KDELR3O43731 214 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 GJB6O95452 261 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 GIMD1P0DJR0 217 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ALPPL2P10696 532 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RABIFP47224 123 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN2P57739 230 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 E2F1Q01094 437 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 STX1AQ16623 288 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZSR6 202 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 PDZD3Q86UT5 571 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 GBP4Q96PP9 640 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 UCKL1Q9NWZ5 548 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 NLGN3Q9NZ94 848 aa21.33■■□□□ 1.01
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 MYLKQ15746 1914 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 POP4O95707 220 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 UBXN1Q04323 297 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 EFHC2Q5JST6 749 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 FAM181AQ8N9Y4 354 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 USP29Q9HBJ7 922 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 POM121BA6NF01 834 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 NEMP2A6NFY4 417 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 WASH4PA8MWX3 477 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CKMT1AP12532 417 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 ABL2P42684 1182 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN6P56747 220 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 PARGQ86W56 976 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 AGPAT1Q99943 283 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP23Q9BVJ7 150 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEB5Q9BZ81 275 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD62A6NC57 917 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 FPGTO14772 594 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 SCAMP1O15126 338 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 RAD51BO15315 384 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 SPINT1O43278 529 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CCP110O43303 1012 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 CSF2P04141 144 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 GP1BAP07359 652 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 NME1P15531 152 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 EPHB2P29323 1055 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 DAB2P98082 770 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 FZD2Q14332 565 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 NCAPHQ15003 741 aa21.3■■□□□ 1
LIMS1-208ENST00000428064 MYLK3Q32MK0 819 aa21.3■■□□□ 1
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