RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420709.5

PRAME-207, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene PRAME, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-207ENST00000420709 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 GPT2Q8TD30 523 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 FGF11Q92914 225 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 FEM1CQ96JP0 617 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 NUP62CLQ9H1M0 184 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 VPS16Q9H269 839 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 NLRC4Q9NPP4 1024 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 GPR27Q9NS67 375 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 OR12D3Q9UGF7 316 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 DACH1Q9UI36 760 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 KLF15Q9UIH9 416 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 NEU3Q9UQ49 428 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 C16orf96A6NNT2 1141 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 KRIT1O00522 736 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 NEMP1O14524 444 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 SCAMP1O15126 338 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 EPHB6O15197 1021 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 SPINT1O43278 529 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 AP1G1O43747 822 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 MPOP05164 745 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 UGT2B4P06133 528 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 SDC4P31431 198 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 ADRA1BP35368 520 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 ACTN2P35609 894 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.321e-7■■■■□ 20.2
PRAME-207ENST00000420709 SGCGQ13326 291 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 TBC1D25Q3MII6 688 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 CDCP2Q5VXM1 449 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 NLRP14Q86W24 1093 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 ZNF354CQ86Y25 554 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 IFI44Q8TCB0 444 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 TMEM248Q9NWD8 314 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 CHD5Q8TDI0 1954 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 NEMP2A6NFY4 417 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 C2CD4BA6NLJ0 364 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 FPGTO14772 594 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 USP12O75317 370 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 CSO75390 466 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 LRIG2O94898 1065 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 CSF2P04141 144 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 NME1P15531 152 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 RHOQP17081 205 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 ITIH2P19823 946 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 MMP8P22894 467 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 RABIFP47224 123 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 HDAC4P56524 1084 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 GABREP78334 506 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 CDR2Q01850 454 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 CDKN3Q16667 212 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 DEFB133Q30KQ1 61 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 ARL13BQ3SXY8 428 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 ZNF805Q5CZA5 627 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 GUSBP11Q6P575 273 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 CRTC1Q6UUV9 634 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 ARCQ7LC44 396 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 PARGQ86W56 976 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 ZNF677Q86XU0 584 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 SPACA3Q8IXA5 215 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 RBFAQ8N0V3 343 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 PYROXD2Q8N2H3 581 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 FAM174AQ8TBP5 190 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 MAPK15Q8TD08 544 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 LMX1AQ8TE12 382 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 FAM172AQ8WUF8 416 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 VOPP1Q96AW1 172 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 TBC1D31Q96DN5 1066 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 IFT43Q96FT9 208 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 KLHL32Q96NJ5 620 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 DEPDC7Q96QD5 511 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 CPED1A4D0V7 1026 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 H3BM21 787 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 CASC3O15234 703 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 AQP9O43315 295 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 RAMP2O60895 175 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 GSRP00390 522 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 JUNDP17535 347 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 TGM2P21980 687 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 SOX5P35711 763 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-207ENST00000420709 IGFALSP35858 605 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms