RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 NADK2Q4G0N4 442 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PID1Q7Z2X4 250 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 SMARCD1Q96GM5 515 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 DDIT4Q9NX09 232 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PCDHGB4Q9UN71 923 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 SRGAP2BP0DMP2 458 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PCSK1P29120 753 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 RPL14P50914 215 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 BHLHA9Q7RTU4 235 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PGAM4Q8N0Y7 254 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 RCN3Q96D15 328 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 CNBD2Q96M20 576 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 DRC3Q9H069 523 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 VANGL2Q9ULK5 521 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 F7P08709 466 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 MYBPC1Q00872 1141 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 SREBF2Q12772 1141 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 KLHDC10Q6PID8 442 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 LCA5Q86VQ0 697 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 DLG3Q92796 817 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF385DQ9H6B1 395 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 SPC25Q9HBM1 224 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 BFARQ9NZS9 450 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PADI3Q9ULW8 664 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 TIMM44O43615 452 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 MGEA5O60502 916 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 APOA4P06727 396 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 EPHA3P29320 983 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 CD52P31358 61 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 TPI1P60174 286 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 CAP1Q01518 475 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 CEACAM7Q14002 265 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 LILRA2Q8N149 483 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 MYLPFQ96A32 169 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 CA12O43570 354 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 TMCC1O94876 653 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 AP2A1O95782 977 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 THPOP40225 353 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 ABCG1P45844 678 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 TM4SF4P48230 202 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 HSPA13P48723 471 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 HERC3Q15034 1050 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 STON2Q8WXE9 905 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 EDEM1Q92611 657 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PPP1R36Q96LQ0 422 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 COLEC11Q9BWP8 271 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 KCNK1O00180 336 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF623O75123 536 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 USP12O75317 370 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 POMCP01189 267 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 CAPNS1P04632 268 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 HCAR3P49019 387 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PKNOX1P55347 436 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 MS4A2Q01362 244 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 TRIM32Q13049 653 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 MPP3Q13368 585 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 USP41Q3LFD5 358 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 LIPMQ5VYY2 423 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 ZYG11AQ6WRX3 759 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 RDH11Q8TC12 318 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 GRIP2Q9C0E4 1043 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 RRN3Q9NYV6 651 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 ODC1P11926 461 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 ME2P23368 584 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 ISLR2Q6UXK2 745 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 NUP205Q92621 2012 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 WDR41Q9HAD4 459 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 APPL1Q9UKG1 709 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 DMTF1Q9Y222 760 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 CFLARO15519 480 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 GRID2O43424 1007 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 B3GAT3O94766 335 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 PIGNO95427 931 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 TFEBP19484 476 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-206ENST00000414253 GRIA4P48058 902 aa24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms