RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 CPNE1Q99829 537 aa21.1■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.1■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 EBF3Q9H4W6 596 aa21.1■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.1■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.1■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.1■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 MPSTP25325 297 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 TSPY1Q01534 308 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 GALNT2Q10471 571 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 RGMBQ6NW40 437 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 NTAN1Q96AB6 310 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 CDH23Q9H251 3354 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 NEMP2A6NFY4 417 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 PAX3P23760 479 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 EFEMP1Q12805 493 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 SERPINE1P05121 402 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 SERPINB5P36952 375 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 GATMP50440 423 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 PLK1P53350 603 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 COG7P83436 770 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 HDAC11Q96DB2 347 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 HSPBAP1Q96EW2 488 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 CASS4Q9NQ75 786 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.09■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 SLC4A1P02730 911 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 HLA-DQB2P05538 268 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 PIRTP0C851 137 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 GABRB3P28472 473 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 LIMK2P53671 638 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 NAGLUP54802 743 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 HPCAP84074 193 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 C1orf146Q5VVC0 180 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 NXNQ6DKJ4 435 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 TMEM135Q86UB9 458 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 HAPLN3Q96S86 360 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 CYP4F12Q9HCS2 524 aa21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
SPRN-201ENST00000414069 CAPN14A8MX76 684 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 CNTN5O94779 1100 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 AHSGP02765 367 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 CYBAP13498 195 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 ZNF24P17028 368 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 EPHA3P29320 983 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 IDH3AP50213 366 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 SPDYAQ5MJ70 313 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 KCTD11Q693B1 232 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 SCD5Q86SK9 330 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 SLC9A7Q96T83 725 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 CHST12Q9NRB3 414 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 TLK1Q9UKI8 766 aa21.08■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 TMEM233B4DJY2 109 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 SIN3BO75182 1162 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 MT-CO1P00395 513 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 F9P00740 461 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 CDH17Q12864 832 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 PSMD5Q16401 504 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 ZNF789Q5FWF6 425 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 SH2D4BQ5SQS7 431 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 GRTP1Q5TC63 336 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 TIFABQ6ZNK6 161 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 SNX31Q8N9S9 440 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 OR52B2Q96RD2 323 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 ACBD6Q9BR61 282 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 COG4Q9H9E3 785 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 NMRAL1Q9HBL8 299 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 NT5MQ9NPB1 228 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 A0A0U1RQF3 1178 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 J3KR12 359 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 IRAK2O43187 625 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 SERPINB8P50452 374 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 PRPSAP1Q14558 356 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 TMEM198Q66K66 360 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 CCDC106Q9BWC9 280 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 NUF2Q9BZD4 464 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 TAGLN3Q9UI15 199 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 TOMM70O94826 608 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 CNTFP26441 200 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 HOXC8P31273 242 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 TUSC3Q13454 348 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 PTPRCAPQ14761 206 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 RNF148Q8N7C7 305 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 NAT9Q9BTE0 207 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.07■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 BIRC5O15392 142 aa21.06■□□□□ 0.96
SPRN-201ENST00000414069 TSPAN8P19075 237 aa21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms