RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389993.7

PSME4-201, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSME4, Length 6,581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-201ENST00000389993 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 FAM228AQ86W67 206 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 HMCESQ96FZ2 354 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 RASSF10A6NK89 507 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 NTRK1P04629 796 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 ITGA2BP08514 1039 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 INSCQ1MX18 579 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 CCDC153Q494R4 210 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 SUSD6Q92537 303 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 ZNF670Q9BS34 389 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 SNX15Q9NRS6 342 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 KAT6AQ92794 2004 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 HOXC6P09630 235 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 WNT3AP56704 352 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 DSG1Q02413 1049 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 OOSP2Q86WS3 158 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 VMP1Q96GC9 406 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 DPY30Q9C005 99 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 PTPRJQ12913 1337 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 GSTM1P09488 218 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 SERPINA4P29622 427 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 MC4RP32245 332 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 KLC1Q07866 573 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 CCDC154A6NI56 674 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 RAD51BO15315 384 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 KCNJ2P63252 427 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 CRYMQ14894 314 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 LZTR1Q8N653 840 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 HBEGFQ99075 208 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 YY1AP1Q9H869 796 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 NUP98P52948 1817 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 COL26A1Q96A83 441 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 CRABP2P29373 138 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 PRKAG1P54619 331 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 BST1Q10588 318 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 TRIM32Q13049 653 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 MFSD3Q96ES6 412 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 MSCO60682 206 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 C1RP00736 705 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 OR56A5P0C7T3 313 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 VAC14Q08AM6 782 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 NRF1Q16656 503 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 CCDC126Q96EE4 140 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 NID2Q14112 1375 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 ADRA1BP35368 520 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 VHLP40337 213 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 FUT10Q6P4F1 479 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 USP45Q70EL2 814 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 IL1R2P27930 398 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 NCALDP61601 193 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 VPS45Q9NRW7 570 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 SELENONQ9NZV5 590 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 ALDH1A2O94788 518 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 PTPN4P29074 926 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 FKBP1BP68106 108 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PSME4-201ENST00000389993 MPP5Q8N3R9 675 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms