RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 COG8Q96MW5 612 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CDRT15Q96T59 188 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 RNF39Q9H2S5 420 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CDH22Q9UJ99 828 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 EDARQ9UNE0 448 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 NCOR1O75376 2440 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 A0A087X0T9 212 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CCDC188H7C350 402 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 TBX3O15119 743 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 KPNA5O15131 536 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CCDC130P13994 396 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 GLRA2P23416 452 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 PRDX6P30041 224 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 RRM2P31350 389 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 L1CAMP32004 1257 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 HARS2P49590 506 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 TFDP1Q14186 410 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ACAP2Q15057 778 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 MAPK6Q16659 721 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 DUSP7Q16829 419 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 LRRC6Q86X45 466 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 C4orf19Q8IY42 314 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CCDC33Q8N5R6 958 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 MARC2Q969Z3 335 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 TNIP3Q96KP6 325 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 FAM167AQ96KS9 214 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 PNMA5Q96PV4 448 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 GPAMQ9HCL2 828 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 VWA7Q9Y334 891 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CPQQ9Y646 472 aa7.35□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 C9IYK1 514 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 GYG2O15488 501 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 MTSS1O43312 755 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ZNF23P17027 643 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CTNNB1P35222 781 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 SOX5P35711 763 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ARHGDIAP52565 204 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 OCA2Q04671 838 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 POU5F1BQ06416 359 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 RAD51Q06609 339 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CAMK1Q14012 370 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 THAP11Q96EK4 314 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 MAGEB18Q96M61 343 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 NELL2Q99435 816 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 APOL6Q9BWW8 343 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 KCNK9Q9NPC2 374 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 TMEM120BA0PK00 339 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 WDR91A4D1P6 747 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 H0Y858 1186 aa7.34□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 H3BNX3 289 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms