RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ZNF235Q14590 738 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 SPRED3Q2MJR0 410 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 FSTL4Q6MZW2 842 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 C16orf46Q6P387 395 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 GPR65Q8IYL9 337 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 MECRQ9BV79 373 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 RETREG1Q9H6L5 497 aa18.11■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 MAB21L3Q8N8X9 362 aa18.08■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 NSMCE3Q96MG7 304 aa18.08■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 TSSK1BQ9BXA7 367 aa18.08■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 KLHL14Q9P2G3 628 aa18.08■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa18.08■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 DCDC2Q9UHG0 476 aa18.08■□□□□ 0.49
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