RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 PTPN2P17706 415 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GLDCP23378 1020 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CHRNA4P43681 627 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ALG1LQ6GMV1 187 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PACS1Q6VY07 963 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 HTR3DQ70Z44 454 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 KDELC2Q7Z4H8 507 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 BBS7Q8IWZ6 715 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 LEMD2Q8NC56 503 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GDAP1Q8TB36 358 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TADA1Q96BN2 335 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 APOPT1Q96IL0 206 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SERAC1Q96JX3 654 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PSKH2Q96QS6 385 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SLC46A2Q9BY10 475 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CHRAC1Q9NRG0 131 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TCAF1Q9Y4C2 921 aa10.65□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CCDC78A2IDD5 438 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 LEFTY2O00292 366 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FAM107AO95990 144 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 NMBRP28336 390 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 AVPR1AP37288 418 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GPM6BQ13491 265 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SEPT6Q14141 434 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TEAD2Q15562 447 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SLC14A2Q15849 920 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ZSCAN26Q16670 478 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ARMC3Q5W041 872 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PKN3Q6P5Z2 889 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 KCNMB4Q86W47 210 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 MFN1Q8IWA4 741 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CNPY4Q8N129 248 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 BANPQ8N9N5 519 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TCEAL4Q96EI5 215 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CHMP6Q96FZ7 201 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CPNE1Q99829 537 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FAM107BQ9H098 131 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ARNT2Q9HBZ2 717 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 VPS28Q9UK41 221 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ACTL7AQ9Y615 435 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CHD9Q3L8U1 2897 aa10.64□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TM9SF1O15321 606 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GJB3O75712 270 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SERPINF2P08697 491 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PYGBP11216 843 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 GP5P40197 560 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ERVK-21P61565 698 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ARF5P84085 180 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 IHHQ14623 411 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SHHQ15465 462 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SLC1A5Q15758 541 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FSCBQ5H9T9 825 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PDPK2PQ6A1A2 396 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CMTM8Q8IZV2 173 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SLC25A41Q8N5S1 370 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 DCAF4L2Q8NA75 395 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SH3RF2Q8TEC5 729 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 DDI1Q8WTU0 396 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 BHMTQ93088 406 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 IFT43Q96FT9 208 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 FEM1CQ96JP0 617 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CCT8L2Q96SF2 557 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 TASP1Q9H6P5 420 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PRKAG3Q9UGI9 489 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 DPP7Q9UHL4 492 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PSAT1Q9Y617 370 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 HEATR9A2RTY3 570 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SNAP91O60641 907 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 MOSPD3O75425 235 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ASMTLO95671 621 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 PAMP19021 973 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 ADRA1DP25100 572 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CCNFP41002 786 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 CSKP41240 450 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 IL9RQ01113 521 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SLC18A2Q05940 514 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 SLC5A9Q2M3M2 681 aa10.63□□□□□ -0.71
COPS2-201ENST00000299259 MPPE1Q53F39 396 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms