RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254730.10

EEFSEC-201, Transcript of eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA specific, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EEFSEC, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSEC-201ENST00000254730 PPM1JQ5JR12 505 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CMC1Q7Z7K0 106 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ITIH5Q86UX2 942 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 MYO1CO00159 1063 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CYP4F8P98187 520 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 SNX15Q9NRS6 342 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 TREX1Q9NSU2 369 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 GGT7Q9UJ14 662 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 EMCNQ9ULC0 261 aa21.95■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 VAPBO95292 243 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CXCL14O95715 111 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 RHOCP08134 193 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.19e-9■■■■□ 23.7
EEFSEC-201ENST00000254730 C16orf46Q6P387 395 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CHST9Q7L1S5 443 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ACVR1CQ8NER5 493 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ZNF599Q96NL3 588 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 A0A1B0GVM2 712 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 E2F8A0AVK6 867 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 MAGEA12P43365 314 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CNGA3Q16281 694 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ISL2Q96A47 359 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CAB39LQ9H9S4 337 aa21.94■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 KDELR3O43731 214 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 GREM1O60565 184 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 OLFM2O95897 454 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 NEFHP12036 1026 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 GABRR2P28476 465 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 TYK2P29597 1187 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 OXCT1P55809 520 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 SIRPB2Q5JXA9 342 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 LILRA6Q6PI73 481 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 GAREM2Q75VX8 874 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CPQQ9Y646 472 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ANKRD36A6QL64 1941 aa21.93■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 ILVBLA1L0T0 632 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 LCHNA4D1U4 455 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 IRX4P78413 519 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 FPGSQ05932 587 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CES4AQ5XG92 561 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 TMC7Q7Z402 723 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 TMC8Q8IU68 726 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 VPS39Q96JC1 886 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 LRRC3Q9BY71 257 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 INSL6Q9Y581 213 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 GLRA3O75311 464 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 HDCP19113 662 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 GABRB3P28472 473 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 SERPINB8P50452 374 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 OVGP1Q12889 678 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 DLG2Q15700 870 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 TMEM240Q5SV17 173 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.92■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 PRKCGP05129 697 aa21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 RGRP47804 291 aa21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 MPP1Q00013 466 aa21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 CNTN4Q8IWV2 1026 aa21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 RANBP9Q96S59 729 aa21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 MGME1Q9BQP7 344 aa21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.91■■□□□ 1.1
EEFSEC-201ENST00000254730 STK39Q9UEW8 545 aa21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms