RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 GBE1Q04446 702 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 GALNT2Q10471 571 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 NCEH1Q6PIU2 408 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SYT12Q8IV01 421 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 EXOC2Q96KP1 924 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 EBF2Q9HAK2 575 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SP110Q9HB58 689 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 DOCK9Q9BZ29 2069 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PALMO75781 387 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K6O95382 1288 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 CDKN2BP42772 138 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 BIRC7Q96CA5 298 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ZNF599Q96NL3 588 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 HDAC8Q9BY41 377 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 VPS45Q9NRW7 570 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 DTLQ9NZJ0 730 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KRIT1O00522 736 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A4O43246 635 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PEX5P50542 639 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ADCY2Q08462 1091 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KIF5AQ12840 1032 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PGBD5Q8N414 524 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 TCEAL3Q969E4 200 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PSKH2Q96QS6 385 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 GJB3O75712 270 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 IGSF6O95976 241 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ITGB7P26010 798 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 CSNK1DP48730 415 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 TEX26Q8N6G2 289 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 TSGA13Q96PP4 275 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KRT10P13645 584 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 CTNNA2P26232 953 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PPP2CBP62714 309 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PPP2CAP67775 309 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 ZNF805Q5CZA5 627 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SYF2-201ENST00000236273 LRRC72A6NJI9 287 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 C16orf96A6NNT2 1141 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 FSBPO95073 299 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 UGT2B4P06133 528 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CR2P20023 1033 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 HOXD12P35452 270 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 IRX4P78413 519 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 LLGL1Q15334 1064 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CACNA1EQ15878 2313 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 WDR45BQ5MNZ6 344 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 NPNTQ6UXI9 565 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SRLQ86TD4 932 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms