RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cntn4Q69Z26 1026 aa22.86■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atp2c1Q80XR2 918 aa22.86■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Csnk1g1Q8BTH8 459 aa22.86■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Castor2Q8CAB8 329 aa22.86■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zbtb6Q8K088 423 aa22.86■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Unc93b1Q8VCW4 598 aa22.86■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ten1Q9D7K2 161 aa22.86■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Chit1Q9D7Q1 464 aa22.86■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr711Q9EPG2 314 aa22.86■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trpc4Q9QUQ5 974 aa22.86■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 ApipQ9WVQ5 241 aa22.86■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pappa2E9PZ87 1789 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Supt3B0QZW4 406 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Neu1O35657 409 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dsg3O35902 993 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Klrb1bP27812 223 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sec31bQ3TZ89 1158 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Klhl14Q69ZK5 630 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nsmce2Q91VT1 247 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dhrs1Q99L04 313 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam136aQ9CR98 138 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 VasnQ9CZT5 673 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 NuggcD3YWJ0 796 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pknox1O70477 436 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 P01740 135 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hbq1bQ3U0A6 142 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Glp2rQ5IXF8 512 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DazlQ64368 298 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q6GQU0 248 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ip6k1Q6PD10 433 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pqlc1Q80XM9 271 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Elmo2Q8BHL5 732 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MiosQ8VE19 875 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddit4Q9D3F7 229 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fiz1Q9WTJ4 500 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ap1m2Q9WVP1 423 aa22.85■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Grpel2O88396 224 aa22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam83fQ3UKU4 495 aa22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arcn1Q5XJY5 511 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Il17aQ62386 158 aa22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Scd4Q6T707 353 aa22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gbp9Q8BTS3 619 aa22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lin52Q8CD94 116 aa22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fbxo21Q8VDH1 627 aa22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pcdhb4Q91XZ6 784 aa22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trpm7Q923J1 1863 aa22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Oxct1Q9D0K2 520 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Borcs5Q9D920 195 aa22.84■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm3259D3YUK0 475 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r27D3YUK6 857 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lamp2P17047 415 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cd86P42082 309 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mxd1P50538 227 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fdft1P53798 416 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ctps2P70303 586 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MyrfQ3UR85 1138 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Six4Q61321 775 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lrfn2Q80TG9 788 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trim8Q99PJ2 551 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rgs10Q9CQE5 181 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nrip2Q9JHR9 270 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slfn2Q9Z0I6 378 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Il18rapQ9Z2B1 614 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm14401A2ARV7 303 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Akain1G3UWD5 69 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 LtfP08071 707 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Plk2P53351 682 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam35aQ3UEN2 891 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lsmem1Q3UQS2 128 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vps51Q3UVL4 782 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Snapc1Q8K0S9 389 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gsg1Q8R1W2 324 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppa2Q91VM9 330 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Haus8Q99L00 373 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mtfr1Q99MB2 328 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DtnaQ9D2N4 746 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ifrd2Q9D8U0 441 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znhit2Q9QY66 399 aa22.83■■□□□ 1.25
Ubp1-204ENSMUST00000214095 A0A1Y7VP24 259 aa22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r74E9PW21 853 aa22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cldn5O54942 218 aa22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Casp2P29594 452 aa22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AdslP54822 484 aa22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Adcyap1r1P70205 496 aa22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atp5jP97450 108 aa22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MafkQ61827 156 aa22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem154Q8C4Q9 181 aa22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wdr11Q8K1X1 1223 aa22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa22.82■■□□□ 1.24
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Smim14Q91VT8 99 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.8 ms