RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000067005.10

Syne3-201, Transcript of Nesprin-3, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syne3, Length 5,097 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3-201ENSMUST00000067005 Vmn2r44L7N2E1 861 aa14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 Epb41P48193 858 aa14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 Igsf9Q05BQ1 1179 aa14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 Tmem247Q497K7 211 aa14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 Acvrl1Q61288 502 aa14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 Map2k2Q63932 401 aa14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 Mbtd1Q6P5G3 631 aa14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 Slc43a1Q8BSM7 564 aa14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 Ccdc81Q9D5W4 654 aa14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Syne3-201ENSMUST00000067005 ClockO08785 855 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Kif1cO35071 1100 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Adora2aQ60613 410 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Prmt6Q6NZB1 378 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Rbbp8Q80YR6 893 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Epb41l5Q8BGS1 731 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Rmdn2Q8BSE0 410 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 LnpepQ8C129 1025 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Olfr866Q8VFI7 312 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 TfQ921I1 697 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Slc44a3Q921V7 656 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 March2Q99M02 246 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Q9CQC3 228 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 CenpnQ9CZW2 337 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Slamf8Q9D3G2 278 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Syvn1Q9DBY1 612 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 RhojQ9ER71 214 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Gria4Q9Z2W8 902 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Syndig1A2ANU3 258 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 MipepA6H611 711 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Fam46dB1ATX6 390 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Zfp277E9Q6D6 583 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 SprtnG3X912 497 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Slc16a8O35308 492 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 CfhP06909 1234 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Smpdl3aP70158 445 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Sel1l2Q3V172 688 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Gja6Q6S5G4 283 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Trim50Q810I2 483 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Orai2Q8BH10 250 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Parp9Q8CAS9 866 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Map3k14Q9WUL6 942 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Glipr1l3A0A1W2P7V2 236 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Pgap3A2A559 320 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Klhdc7aA2APT9 773 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Cyp2b13A6H6J2 491 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Ttc7bE9Q6P5 843 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Cyp2b9P12790 491 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Ccnb1P24860 430 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 SarsP26638 512 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Lpcat1Q3TFD2 534 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Slc9b2Q5BKR2 547 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Gadl1Q80WP8 550 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Azin2Q8BVM4 459 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Snrpb2Q9CQI7 225 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Trim13Q9CYB0 407 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Anks3Q9CZK6 655 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Ccdc120A2AEV7 629 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Ddx43D3Z6P9 646 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Mmp15O54732 657 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Cd68P31996 326 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Prox1P48437 737 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Slc17a7Q3TXX4 560 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Vps72Q62481 368 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Klhl23Q6GQU2 558 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 SarafQ8R3Q0 334 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 2310003L06RikQ9CV82 495 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Olfr704Q9EPF6 315 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Arid3bQ9Z1N7 568 aa14.89□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Ccdc149F6V035 524 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Aldh1a7O35945 501 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Cd247P24161 164 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Ccng1P51945 294 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Ca4Q64444 305 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Larp4bQ6A0A2 741 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Lrrc27Q80YS5 523 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Lrrc4cQ8C031 640 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Wdr59Q8C0M0 992 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Agbl2Q8CDK2 862 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Pkn3Q8K045 878 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Ferd3lQ923Z4 168 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Zmat2Q9CPW7 199 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Racgap1Q9WVM1 628 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 CrnnD3YUU6 520 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Gm8257E9Q8R3 264 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 PenkP22005 268 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Mtf2Q02395 593 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 G2e3Q5RJY2 716 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 Fnip1Q68FD7 1165 aa14.88□□□□□ -0.03
Syne3-201ENSMUST00000067005 IgtpQ9DCE9 423 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.2 ms