RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elmo2Q8BHL5 732 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Castor2Q8CAB8 329 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx9Q91VH2 595 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfaip8l2Q9D8Y7 184 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh22Q9WTP5 813 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep350E9Q309 3095 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ssxb8B1AY40 170 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 1600015I10RikE9Q745 711 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3043K7N693 218 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm16440K7N6G6 218 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm2244L7N2A3 218 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3278L7N2D2 218 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8271L7N2E2 218 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Naa20P61600 178 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mpzl3Q3V3F6 237 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf451Q8C0P7 1056 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp566Q8VCI1 386 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdha11Q91Y19 950 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pole4Q9CQ36 118 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rec114Q9CWH4 259 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf687Q9D2D7 1237 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Egfl7Q9QXT5 275 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5751A2AHC8 147 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbed5B2RPU8 756 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acp4D3YTS9 425 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prox1P48437 737 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Morf4l1P60762 362 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Axdnd1Q3UZ57 424 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hsfy2Q80Y37 392 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mapkap1Q8BKH7 522 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgap28Q8BN58 729 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oit3Q8R4V5 546 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc5a9Q8VDT1 685 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Epm2aip1Q8VEH5 606 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rgs10Q9CQE5 181 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ddx59Q9DBN9 619 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smad9Q9JIW5 430 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DgkdE9PUQ8 1220 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptpn9O35239 593 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ldb1P70662 411 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PhexP70669 749 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ikzf1Q03267 517 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc22a16Q497L8 649 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PostnQ62009 838 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smpd4Q6ZPR5 823 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aqp12Q8CHJ2 290 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ipo11Q8K2V6 975 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbmx2Q8R0F5 326 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prmt7Q922X9 692 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gprc5bQ923Z0 410 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gmpr2Q99L27 348 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acot13Q9CQR4 140 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cldn3Q9Z0G9 219 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wfdc16A2A5H4 111 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhox3fA2ANE1 215 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r14E9Q759 848 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5145F8VQ88 278 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc16a9Q7TM99 508 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cgrrf1Q8BMJ7 332 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr711Q9EPG2 314 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SmoktcrA2KF29 484 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr292F8VQ84 308 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fignl2J3QK54 644 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3336J3QMQ6 198 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Neu1O35657 409 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NadkP58058 439 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adamts1P97857 968 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc45a4Q0P5V9 785 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem237Q3V0J1 427 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5414Q6IFZ8 552 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ano4Q8C5H1 955 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MydgfQ9CPT4 166 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PolkQ9QUG2 852 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh3pxd2aO89032 1124 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hk1P17710 974 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asprv1Q09PK2 339 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb48Q1H9T6 681 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sema4aQ62178 760 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rap2cQ8BU31 183 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lca5lQ8C0X0 741 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmc7Q8C428 726 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Celf3Q8CIN6 465 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Erich5Q8K0S2 362 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc35c2Q8VCX2 364 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slco1a5Q91YY5 670 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm15155B1B034 138 aa16.23■□□□□ 0.19
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3739L7N296 216 aa16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.9 ms