RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620722.4

CACNA2D3-212, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-212ENST00000620722 TNFRSF10AO00220 468 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 KCNQ2O43526 872 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 CABYRO75952 493 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 DNAJB5O75953 348 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 PARNO95453 639 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 CHRNGP07510 517 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 LIG4P49917 911 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 PRAMEP78395 509 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 KRT76Q01546 638 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 NME3Q13232 169 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 SPATS1Q496A3 300 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 C6orf183Q5T699 404 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 WDR49Q8IV35 697 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 DCLK2Q8N568 766 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 USP33Q8TEY7 942 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 SNX19Q92543 992 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 HPS1Q92902 700 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 CPXM1Q96SM3 734 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 HOXD1Q9GZZ0 328 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 ADA2Q9NZK5 511 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 BTAF1O14981 1849 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TARM1B6A8C7 271 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 H0YIN7 160 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 DPYSL4O14531 572 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 AREL1O15033 823 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 MED7O43513 233 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TIPRLO75663 272 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CCNE2O96020 404 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 LTFP02788 710 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SBK3P0C264 359 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 GRIA1P42261 906 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ACOT2P49753 483 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 BCAR1P56945 870 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 MYL6P60660 151 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 JAG1P78504 1218 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SNX17Q15036 470 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMEM198Q66K66 360 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 REP15Q6BDI9 236 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 LCN8Q6JVE9 175 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 DHFR2Q86XF0 187 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 LACC1Q8IV20 430 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 HACE1Q8IYU2 909 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TNS4Q8IZW8 715 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 EMC1Q8N766 993 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 IL31RAQ8NI17 732 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 PGBD4Q96DM1 585 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 YME1L1Q96TA2 773 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TBCBQ99426 244 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.09□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 C2CD4BA6NLJ0 364 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CENPBD1B2RD01 187 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SDHDO14521 159 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 NEMP1O14524 444 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CLOCKO15516 846 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 NUAK1O60285 661 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 DGAT1O75907 488 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 PIGNO95427 931 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 HMGCRP04035 888 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 GSTM2P28161 218 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 NR2C2P49116 596 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TGFB2P61812 414 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SQLEQ14534 574 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SMUG1Q53HV7 270 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 MFSD4AQ8N468 514 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 KDM1BQ8NB78 822 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 LEMD2Q8NC56 503 aa7.08□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.08□□□□□ -1.28
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